新生儿碘缺乏可能导致智力发育迟缓、甲状腺功能减退、生长发育障碍、听力语言能力受损以及免疫功能下降。碘是合成甲状腺激素的关键原料，对胎儿和新生儿的神经系统发育尤为重要。
碘缺乏会直接影响甲状腺激素的合成，而甲状腺激素对大脑发育至关重要。新生儿期碘不足可能导致不可逆的智力损伤，表现为认知功能低下、学习能力差。严重缺碘地区儿童平均智商可能显著低于正常水平，且这种损害在后期补碘后难以完全逆转。
长期碘缺乏会导致新生儿甲状腺代偿性肿大，形成地方性克汀病。甲状腺激素分泌不足会引起基础代谢率降低，出现体温偏低、嗜睡、喂养困难等症状。若不及时干预，可能发展为永久性甲状腺功能减退。
甲状腺激素参与骨骼生长和器官发育，碘缺乏新生儿可能出现身材矮小、骨龄延迟。典型表现为头围偏小、前囟闭合延迟、出牙晚等发育滞后征象，部分患儿会伴随肌肉张力低下和运动发育迟缓。
内耳发育需要甲状腺激素调节，严重碘缺乏可能导致感音神经性耳聋。这类患儿常伴有语言发育迟缓，表现为对声音反应迟钝、语言表达能力落后于同龄儿童。早期筛查发现听力障碍有助于及时康复干预。
甲状腺激素参与免疫系统调节，碘缺乏新生儿更易发生反复感染。临床可见呼吸道感染频率增加、伤口愈合缓慢等表现，严重者可能并发肺炎等严重感染性疾病。
预防新生儿碘缺乏应从孕期开始，孕妇需保证每日碘摄入量。母乳喂养的母亲应注意膳食碘补充，配方奶喂养需选择含碘配方。新生儿筛查包含甲状腺功能检测，发现异常需立即内分泌科就诊。日常护理中避免使用无碘盐，沿海地区居民也应重视碘营养状况监测。对于已确诊缺碘的新生儿，应在医生指导下进行规范化碘剂补充治疗，并定期评估生长发育指标。
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